“A comissão pedagógica é o órgão científico-pedagógico de direção estratégica, coordenação, supervisão e acompanhamento do plano de formação e do plano de atividades do CFAE.”
(n.º 1, do artigo 12.º, do Decreto-Lei n.º 127/2015, de 7 de julho)
 
Constituição
 
Dr. Rui dos Anjos Domingues Velho
Diretor do CFAE (Presidente)
 
Conselho de Diretores
Dr. António Carlos Pereira Baptista
Diretor do Agrupamento de Escolas Guilherme Correia Carvalho, Seia 
Dr. Manuel António de Almeida Portugal
Diretor do Agrupamento Escolas de Celorico da Beira
Dr. Marco Hélder Calçada Fernandes
Diretor do Agrupamento de Escolas de Fornos de Algodres
Dr. Jorge Manuel Rodrigues Martins
Diretor do Agrupamento de Escolas de Gouveia
Dr. Luís Filipe Branco Lopes
Diretor do Agrupamento de Escolas de Meda
Doutora Maria Margarida Cardoso Africano Fernandes Amaral
Diretora do Agrupamento de Escolas de Seia
Dr. Armando Jorge Gonçalves de Almeida Neves
Diretor do Agrupamento de Escolas de Trancoso
Dra. Maria Elisabete da Silva Bárbara
Diretora do Agrupamento de Escolas Padre José Augusto da Fonseca, Aguiar da Beira
 
Secção de formação e monitorização
Dr. Horácio Marques dos Santos
Responsável do Plano de Formação do Agrupamento de Escolas Guilherme Correia de Carvalho, Seia
Dr.ª Maria Gentil Palavras Paulo Barroso
Responsável do Plano de Formação do Agrupamento de Escolas de Celorico da Beira
Drª. Maria José Rodrigues
Responsável do Plano de Formação do Agrupamento de Escolas de Fornos de Algodres
Dr. Carlos Alexandre da Silva Dias Marques
Responsável do Plano de Formação do Agrupamento de Escolas de Gouveia
Dr.ª Ana Maria Marcos Moura Pereira
Responsável do Plano de Formação do Agrupamento de Escolas de Meda
Dr. Humberto Jorge Alves da Silva Santos 
Responsável do Plano de Formação do Agrupamento de Escolas de Seia
Dr.ª Inês Catarina Pacheco Augusto
Responsável do Plano de Formação do Agrupamento de Escolas de Trancoso
Dr. José Armando da Silva de Gouveia e Sousa
Responsável do Plano de Formação do Agrupamento de Escolas Padre José Augusto da Fonseca, Aguiar da Beira